El SEPMUD es una institución pública descentralizada de derecho público, con personería jurídica, autónoma de gestión administrativa, financiera, legal, técnica y patrimonio propio, bajo tuición del Ministerio de Culturas, Descolonización y Despatriarcalización. El SEPMUD fue creado el 16 de enero de 2019 a través del Decreto Supremo 3774, sin embargo, inició sus funciones el 8 de marzo de 2019.